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导读:
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本文目录一览:
空间转录如何实现空间信息获取
1、原位杂交:通过化学或荧光信号标记能够与特定转录本特异性结合的探针序列,在杂交后检测探针上的化学或荧光信号,利用成像技术获得基因的空间表达信息。如smFISH、MERFISH和Nanostring CosMx SMI等技术。
2、核心步骤拆解 第一步:捕获单细胞信息——用微流控或激光显微切割技术分离单个细胞,保留其RNA(遗传活动信号)。 第二步:标记空间坐标——通过特殊玻片或荧光探针,给每个细胞所在位置打上“条形码”(例如网格坐标)。
3、空间信息捕获:通过空间条形码技术,将基因表达信号定位到组织切片的原始位置,保留空间上下文信息。数据分析流程:结合组织学染色(如H&E)或免疫荧光(IF)结果,将转录组数据与形态学特征或蛋白表达模式关联,实现多维度分析。


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