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本文目录一览：

• 1、空间转录如何实现空间信息获取

空间转录如何实现空间信息获取

原位杂交：通过化学或荧光信号标记能够与特定转录本特异性结合的探针序列，在杂交后检测探针上的化学或荧光信号，利用成像技术获得基因的空间表达信息。如smFISH、MERFISH和Nanostring CosMx SMI等技术。

核心步骤拆解 第一步：捕获单细胞信息——用微流控或激光显微切割技术分离单个细胞，保留其RNA（遗传活动信号）。 第二步：标记空间坐标——通过特殊玻片或荧光探针，给每个细胞所在位置打上“条形码”（例如网格坐标）。

在空间转录组测序过程中，首先对组织样本进行细致的切片处理，并确保每个切片都得到妥善固定。接着，运用原位杂交或基于微阵列的策略捕获并标记组织切片中的RNA分子，确保每个位置的RNA能够被精确识别。

空间信息重构技术提供了获取空间位置的另一种思考方式，尽管分辨率较低，但仍为实际问题提供了实用的解决方案。在实际应用中，需要根据研究目的、样本类型、成本预算等因素综合考虑选择合适的空间转录组技术。

通过数据分析，可以获得包含精确空间位置信息的转录组数据。这些数据为研究细胞在组织中的分布、功能以及相互作用提供了重要依据。以基于微阵列的空间转录组测序技术为例： 载玻片上排列着大量的捕获探针，这些探针能够特异性结合特定的RNA分子。

测序后，根据数据的条形码信息对数据进行分配，确定其来源位置，最终实现空间基因表达的可视化。实验流程 Visium空间转录组技术的实验流程包括：组织切片：对新鲜冷冻组织或FFPE组织进行切片，并将其放置在文库制备玻片上。固定与染色：对组织进行固定，并通过HE或免疫荧光（IF）染色进行成像。

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